Así en 1869 inició su carrera de medicina en Zaragoza. Se incorpora al ejército y es enviado a Cuba donde contrae el paludismo y es retornado a España.
En 1877 logra su doctorado y se incorpora como profesor en la facultad de medicina de Zaragoza para pasar a ser director de los museos anatómicos de la misma en 1879. Mas tarde ganó la Cátedra de Anatomía de la facultad de Valencia.
EN 1889 descubre los mecanismos que gobiernan la morfología y los procesos conectivos de las células nerviosas de la materia gris del sistema nervioso cerebreoespinal.
Su esquema estructural del sistema nervioso como un conglomerado de unidades independientes y definidas pasó a conocerse como "doctrina de la neurona". Ya en Madrid pasa a trabajar en el Laboratoio de Investigaciones Biológicas y más tarde crea su propio instituto, Instituo Cajal, donde mantendrá su labor científica hasta la muerte.
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