Las sustancias que ingresan al citoplasma pueden ser utilizadas en diferentes funciones metabolicas, como la digestión, la respiración y la síntesis de proteínas. Pero, para ello, es necesario que el interior de la célula se ponga en acción, Así lo hace:
Las grandes moléculas que penetran por fagocitosis o pinocitosis no pueden pasar directamente a formar parte de los componentes de la célula. Por lo tanto, previamente, son transformadas en moléculas más simples mediante un proceso: la digestión celular.
Una vez simplificadas, las moléculas pueden incorporarse al citoplasma, es decir, son asimiladas. De este modo, estas sustancias simples se encuentran ya en condiciones de ser utilizadas por la célula como fuente de energía en la respiración, o bien como material para la sintesis de otras sustancias.
Ahora bien, mediante el proceso de repiracion las células utilizan el oxigeno para liberar la energía almacenada en los alimentos.
La glucosa, es la principal sustancia utilizada como fuente de energía en la respiración celular. Esta junto con el oxigeno se combina dentro de la mitocondria produciendose la oxidación (combustión lenta) de las sustancias orgánicas. El resultado es la formación de dioxido de carbono y agua y la liberación de una parte de energia quimica: la porción restante, queda almacenada en la mitocondrias. Esta puede ser utilizada en la síntesis, el transporte interno, o la entrada al citoplasma de sustancias, la eliminación de desechos o secreciones al medio, la reproduccion del protoplasma. En cuanto al dioxido de carbono, es eliminado en la respiracion, a través de la membrana plasmatica; con el agua, es utilizada en parte por la célula, el excedente es eliminado junto con el dioxido de carbono.
La última de las funciones ,etabolicas es la sintesis de proteinas. La misma celula se encarga de fabricar las proteinas que necesita a partir de los aminoacidos (sustancias inorganicas) asimiladas. Este proceso está controlado por el ADN quien rige todas las actividades que realiza la célula y se encuentra en el núcleo. Los aminoacidos se transforman en proteinas en el interior de los ribosomas.