Se subdividen en dos grupos, las cianógenas (niños azules, por el color de piel y mucosas) y las acianógenas (color normal de la piel)
- Las cardiopatias congénitas cianógenas: son más graves, y en muchas ocasiones incompatibles con la vida. Las dos cardiopatias cianógenas más frecuentes son la tetralogía de Fallot y la transposicion de las grandes arterias (la aorta sale del ventrículo izquierdo). Es habitualmente necesario la actucaión del cirujano cardiaco infantil, quien de forma definitiva o parcial arregla los importantes trastornos.
- las cardiopatías congénitas acianógenas: suelen permitir una mayor supervivencia. De hecho, alguna de ellas, como la comunicación interventricular o la interauricular (agujeros que persisten al nacimiento permitiendo el paso anormal de sangre de uno a otro ventriculo o de una a otro aurícula), pueden descubrirse en la edad adulta, no limitan la actividad deportiva y en algunos casos no precisan de reparación quirúrgica.
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